В 2011 году Государственный художественный музей Алтайского края стал участником федеральной целевой программы "Культура России". В программу вошел проект, связанный с реставрацией алтайской иконы. Это третье участие художественного музея в федеральной программе за последние 5 лет. Кроме того, музей ежегодно (с 2007 года) получает финансирование основных направлений деятельности по краевой целевой программе "Культура Алтая", в том числе и по реставрации произведений искусства.
Для музея проблема реставрации стоит особенно остро, так как предстоит реконструкция здания музея, и коллектив уже сейчас готовит проекты будущих постоянных экспозиций, площади которых увеличатся в три раза.
В настоящее время в музее работают реставраторы из подмосковного историко-архитектурного и художественного музея "Новый Иерусалим". Они реставрируют 8 алтайских икон по договору, среди них - сузунские иконы и иконы Викулы Балыкина, залесовского иконописца. Эти иконы относятся ко второй половине 19 - началу 20 века. Кроме того, сугубо из музейной солидарности, благотворительно, новоиерусалимские реставраторы провели профилактические работы с целым рядом произведений.
Всего за последние пять лет художественный музей отреставрировал по федеральной и краевой программам более 50 произведений.
